home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9409c.zip / M9490428.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-09-19  |  3KB  |  47 lines
  1.        Document 0428
  2.  DOCN  M9490428
  3.  TI    A molecular rheostat. Co-operative rev binding to stem I of the
  4.        rev-response element modulates human immunodeficiency virus type-1 late
  5.        gene expression.
  6.  DT    9411
  7.  AU    Mann DA; Mikaelian I; Zemmel RW; Green SM; Lowe AD; Kimura T; Singh M;
  8.        Butler PJ; Gait MJ; Karn J; MRC Laboratory of Molecular Biology,
  9.        Cambridge, U.K.
  10.  SO    J Mol Biol. 1994 Aug 12;241(2):193-207. Unique Identifier : AIDSLINE
  11.        MED/94334977
  12.  AB    The complete biologically active human immunodeficiency virus type-1
  13.        (HIV-1) rev-response element (RRE) RNA is 351 nucleotides (nt) in
  14.        length, and includes an extra 58 nt on the 5' end and 59 nt on the 3'
  15.        end beyond the sites proposed in the original models for the RRE
  16.        secondary structure. The extra sequences are able to form a duplex
  17.        structure which extends Stem I. The presence of an elongated Stem I
  18.        structure in the RRE RNA was confirmed by nuclease mapping experiments.
  19.        Nuclease protection experiments have shown that rev binds to restricted
  20.        regions of the RRE, including the high affinity site located at the base
  21.        of Stem IIb and along the length of the Stem I region. The three large
  22.        stem-loop structures which protrude from Stem I and Stem IIb (Stems IIc,
  23.        III+IV and V) remain accessible to nucleases even in the presence of a
  24.        large excess of protein. Gel-retardation experiments show that the
  25.        truncations of Stem I reduced the total number of rev molecules that can
  26.        bind co-operatively and with high affinity to the RRE RNA. To test
  27.        whether the elongated Stem I structure is required for maximal rev
  28.        activity, a series of truncations which progressively reduced the length
  29.        of Stem I was introduced into an HIV-1 derived reporter plasmid. In the
  30.        presence of rev and a functional RRE, there is an increase in the levels
  31.        of gag and env mRNA in the cytoplasm and a decrease in levels of tat and
  32.        rev mRNAs. Each of the truncations in Stem I reduced the rev responses,
  33.        with the longest truncations producing the greatest losses of activity.
  34.        The data suggest that the RRE acts as a molecular rheostat designed to
  35.        detect rev levels during the early stages of the HIV growth cycle.
  36.  DE    Base Sequence  Binding Sites  Electrophoresis, Polyacrylamide Gel  Gene
  37.        Expression Regulation, Viral/*GENETICS  Gene Products, rev/*METABOLISM
  38.        Genes, env/*GENETICS  Genes, gag/GENETICS  Genes, tat/GENETICS  Hela
  39.        Cells  Human  HIV-1/*GENETICS  Molecular Sequence Data  Mutagenesis
  40.        Nucleic Acid Conformation  Polymerase Chain Reaction  RNA,
  41.        Viral/CHEMISTRY/*GENETICS/METABOLISM  Support, Non-U.S. Gov't
  42.        Transfection  JOURNAL ARTICLE
  43.  
  44.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  45.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  46.  
  47.